ইউপিআই লেনদেনে ফি সংক্রান্ত জল্পনা চললেও সাধারণ ব্যবহারকারীদের জন্য এটি এখনও সম্পূর্ণ বিনামূল্যে। সরকার স্পষ্ট করেছে যে গ্রাহকদের ওপর কোনো অতিরিক্ত চার্জ আরোপ করা হয়নি, তবে বড় মার্চেন্ট লেনদেনের ক্ষেত্রে এমডিআর (MDR) নিয়ে আলোচনা চলছে।
ভারতে ইউপিআই (UPI) লেনদেনের ওপর ফি আরোপের বিষয়টি নিয়ে নতুন করে আলোচনা শুরু হলেও সাধারণ ব্যবহারকারীদের জন্য স্বস্তির খবর রয়েছে। সরকার নিশ্চিত করেছে যে ব্যাংক অ্যাকাউন্ট থেকে ইউপিআই পেমেন্ট করার জন্য গ্রাহকদের কাছ থেকে কোনো অতিরিক্ত ফি নেওয়া হবে না। সাম্প্রতিক সংসদীয় আইনি পরিবর্তন ভবিষ্যতে ডিজিটাল পেমেন্টের ওপর চার্জ বা ছাড় নির্ধারণের পথ খুলে দিলেও, এর মানে এই নয় যে ইউপিআই-তে এখনই কোনো ফি কার্যকর হয়েছে।
বর্তমানে বিতর্কের মূল কেন্দ্রবিন্দু হলো মার্চেন্ট ডিসকাউন্ট রেট বা MDR। ইউপিআই বর্তমানে 'জিরো-এমডিআর' মডেলে চলছে, যেখানে বড় লেনদেনের ক্ষেত্রে মার্চেন্টদের কাছ থেকে ফি নেওয়ার সম্ভাবনা নিয়ে আলোচনা হচ্ছে। উল্লেখ্য যে, ফোনপে বা গুগল পে নিজে ইউপিআই নয়, বরং এগুলো হলো ইউপিআই নেটওয়ার্ক ব্যবহারকারী অ্যাপ। ইউপিআই মূলত একটি ডিজিটাল পেমেন্ট অবকাঠামো যা রিয়েল-টাইম টাকা স্থানান্তরের সুবিধা দেয়।
২০১৬ সালে শুরু হওয়া এই সিস্টেমটি এখন ভারতের ডিজিটাল পেমেন্টের প্রায় ৮৫% নিয়ন্ত্রণ করে। এই বিশাল সিস্টেম পরিচালনার খরচ সরকার ভর্তুকির মাধ্যমে বহন করে আসছে। বড় মার্চেন্টদের ক্ষেত্রে নির্দিষ্ট সীমার উপরে লেনদেনে সামান্য এমডিআর চার্জ করার প্রস্তাব থাকলেও, সাধারণ মানুষের পকেটে এর কোনো প্রভাব পড়বে না বলে জানানো হয়েছে।